60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3163 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  60.78 
 
 		 368 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  65.42 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  54.51 
 
 		 374 aa  248  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  54.04 
 
 		 401 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  56.44 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  47.72 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  43.59 
 
 		 373 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  37.33 
 
 		 681 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 		 522 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  32.93 
 
 		 1234 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  38.2 
 
 		 353 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  36.23 
 
 		 759 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  36.5 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  32.65 
 
 		 828 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 528 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 1282 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 329 aa  101  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  39.19 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  32.08 
 
 		 749 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  35.89 
 
 		 688 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  35.19 
 
 		 374 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  34.42 
 
 		 921 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 		 576 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  32.2 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  33.64 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  34.29 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 366 aa  81.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  29.5 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  31.53 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  31.19 
 
 		 869 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  27.51 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  26.43 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.22 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  28.11 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  28.29 
 
 		 648 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  26.17 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.34 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  26.52 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  26.47 
 
 		 612 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  26.83 
 
 		 1072 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  35.78 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  27.36 
 
 		 506 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  25.34 
 
 		 372 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  26.49 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.53 
 
 		 183 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  27.51 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  23.5 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  25 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  24.62 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  26.7 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  26.23 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  29.76 
 
 		 479 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  26.7 
 
 		 195 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  25.12 
 
 		 255 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.88 
 
 		 262 aa  42  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  25.55 
 
 		 345 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>