32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2470 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  100 
 
 		 506 aa  1006    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  49.19 
 
 		 612 aa  326  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  35.52 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  31.41 
 
 		 343 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  30.42 
 
 		 345 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 847 aa  97.1  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  30.38 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  30.04 
 
 		 1234 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  31.44 
 
 		 828 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  30.09 
 
 		 329 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  30.58 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  30.05 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  29.25 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  31.05 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  26.55 
 
 		 378 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  27.98 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  28.95 
 
 		 749 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  29.03 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  27.13 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  25.55 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  31.13 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  24.32 
 
 		 681 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  28.97 
 
 		 349 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  26.42 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  23.38 
 
 		 759 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.17 
 
 		 424 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  27.36 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  25.93 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  25.91 
 
 		 256 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  26.71 
 
 		 1172 aa  43.5  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.89 
 
 		 528 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>