43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4057 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  65.87 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  57.76 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  65.42 
 
 		 241 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  58.47 
 
 		 401 aa  261  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  62.19 
 
 		 349 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  52.26 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45.36 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  39.6 
 
 		 681 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.81 
 
 		 528 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  37.1 
 
 		 759 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  30.22 
 
 		 522 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  37.66 
 
 		 353 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  32.71 
 
 		 1234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 1282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  36.92 
 
 		 688 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  32.92 
 
 		 828 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  33.96 
 
 		 749 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  32.17 
 
 		 329 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  34.93 
 
 		 374 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 		 366 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  37.07 
 
 		 358 aa  95.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  30.29 
 
 		 378 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  31.84 
 
 		 921 aa  92  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  27.71 
 
 		 576 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  33.49 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  29.15 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  31.22 
 
 		 869 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  25.82 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  26.27 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  32.48 
 
 		 593 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  29.93 
 
 		 479 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  24.17 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  25.37 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  29.9 
 
 		 506 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  25.12 
 
 		 255 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  25.33 
 
 		 345 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>