77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2225 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
378 aa  757    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  61.98 
 
 
828 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  61.29 
 
 
749 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  54.33 
 
 
1234 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  54.4 
 
 
522 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  44.27 
 
 
576 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  45.16 
 
 
329 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 
468 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40.91 
 
 
366 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  36.1 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  35.71 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.71 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  31.8 
 
 
311 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  32.62 
 
 
358 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  30.86 
 
 
255 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  31.19 
 
 
759 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  32.26 
 
 
349 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.33 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  29.91 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  33.04 
 
 
681 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  32.09 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.07 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  26.15 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  26.64 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  26.19 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  27.6 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  29 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  30.09 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  26.17 
 
 
506 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 
1282 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  26.24 
 
 
222 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  25 
 
 
201 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  25.67 
 
 
234 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  26.03 
 
 
1072 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  26.03 
 
 
921 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  22.3 
 
 
339 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  24.7 
 
 
215 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  25.28 
 
 
201 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  25 
 
 
201 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 
869 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  25.43 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  26.98 
 
 
213 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  24.48 
 
 
217 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  24.73 
 
 
199 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  26.57 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 
593 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  26.88 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  27.64 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.65 
 
 
241 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 
847 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  25.41 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  28.03 
 
 
237 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  24.65 
 
 
239 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  26.03 
 
 
213 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  27.69 
 
 
189 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  26.53 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  26.39 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  27.14 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.94 
 
 
241 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  28.89 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  25 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  26.62 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  25.81 
 
 
205 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.46 
 
 
228 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  24.37 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  23.78 
 
 
202 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  26.09 
 
 
195 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.43 
 
 
211 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  25.11 
 
 
198 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 
214 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  23.67 
 
 
233 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25.88 
 
 
196 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  28.67 
 
 
223 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>