29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0180 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 339 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  35.49 
 
 		 506 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  35.11 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  34.12 
 
 		 612 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  32.76 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 		 847 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  28.48 
 
 		 828 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  27.3 
 
 		 749 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  34.81 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  29.01 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  26.74 
 
 		 1234 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  30.83 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  35.11 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  30.71 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  39.17 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  22.77 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  30.25 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  27.15 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  29.66 
 
 		 468 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  25.32 
 
 		 681 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  24.05 
 
 		 759 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 1282 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  26 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  28.22 
 
 		 576 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  23.68 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  26.99 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  26.36 
 
 		 688 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>