77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1877 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
576 aa  1157    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  54.21 
 
 
749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  45.23 
 
 
828 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  46.61 
 
 
522 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  44.35 
 
 
378 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  44.4 
 
 
1234 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  47.35 
 
 
468 aa  186  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  41.32 
 
 
329 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  38.43 
 
 
909 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.73 
 
 
366 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0471  hypothetical protein  34.33 
 
 
356 aa  123  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.876595  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  34.09 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  33.06 
 
 
353 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  29.82 
 
 
374 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0705  hypothetical protein  31.22 
 
 
346 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.318197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0651  hypothetical protein  31.37 
 
 
347 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.020449  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  31.1 
 
 
349 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  31.93 
 
 
358 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  29.55 
 
 
847 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  31.55 
 
 
311 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  29.61 
 
 
401 aa  97.1  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  35 
 
 
255 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  29.13 
 
 
862 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  28.31 
 
 
368 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  26.57 
 
 
681 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.91 
 
 
528 aa  87.4  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  28.37 
 
 
261 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  28.44 
 
 
241 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  30.37 
 
 
612 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  28.17 
 
 
1231 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  29.85 
 
 
616 aa  77.8  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.88 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  26.91 
 
 
759 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  30.19 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  25.93 
 
 
343 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3033  hypothetical protein  30.24 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  28.31 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  25.11 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  29.67 
 
 
688 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  26.46 
 
 
892 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  26.67 
 
 
921 aa  60.8  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  26.45 
 
 
941 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 
266 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0459  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.115859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1675  hypothetical protein  27.03 
 
 
339 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  26.72 
 
 
256 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  29.69 
 
 
212 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
366 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 
1282 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  27.46 
 
 
234 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  26.81 
 
 
209 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  30 
 
 
210 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  30 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  30 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  27.04 
 
 
345 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  30 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  24.78 
 
 
252 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  30 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  30 
 
 
210 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  26.03 
 
 
205 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  25.31 
 
 
248 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 
847 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  24.44 
 
 
201 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  24.83 
 
 
202 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1551  hypothetical protein  27.8 
 
 
303 aa  47.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285681  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  24.73 
 
 
201 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  24.86 
 
 
199 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  26.9 
 
 
226 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  27.21 
 
 
219 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3252  Sialate O-acetylesterase  23.33 
 
 
689 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  24.43 
 
 
222 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  24.58 
 
 
249 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  24.73 
 
 
201 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  24.86 
 
 
215 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.53 
 
 
216 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  24.7 
 
 
202 aa  43.9  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  26.21 
 
 
214 aa  43.9  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>