44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3994 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  537  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.67 
 
 		 366 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  35.56 
 
 		 353 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.27 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  32.41 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  33.18 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  29.3 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  29.13 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  29.44 
 
 		 1234 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  29 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  27.35 
 
 		 828 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  27.59 
 
 		 749 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  24.77 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  24.58 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  26.72 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  26.42 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  27.23 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  28.97 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  25.35 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  25.22 
 
 		 468 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  25.81 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  23.94 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  22.89 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  24.55 
 
 		 681 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  21.86 
 
 		 1282 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  22.93 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  25 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  24.64 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  23.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  23.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  25.11 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  23.7 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  23.11 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  23.04 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  24.17 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  26.28 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  24.31 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  21.92 
 
 		 401 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  23.7 
 
 		 199 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  23.39 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  21.34 
 
 		 212 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  24.54 
 
 		 201 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  29.05 
 
 		 759 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>