250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4516 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  100 
 
 		 349 aa  694    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  64.42 
 
 		 368 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  54.39 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  54.11 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  59.55 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  51.17 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  55.29 
 
 		 241 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  40.22 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  43.14 
 
 		 681 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  40.52 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.81 
 
 		 528 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45.64 
 
 		 373 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.92 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  58.59 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 		 1282 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  36.71 
 
 		 759 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  33.61 
 
 		 1234 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  33.05 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  32.02 
 
 		 749 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  30.67 
 
 		 576 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  55.43 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  31.82 
 
 		 828 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  37.76 
 
 		 688 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  50.48 
 
 		 673 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  30.84 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  36.32 
 
 		 255 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  31 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  35.78 
 
 		 921 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  48.45 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  58.43 
 
 		 89 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.48 
 
 		 477 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  48.96 
 
 		 451 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  49.09 
 
 		 702 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  55.56 
 
 		 468 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  52.13 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  49.48 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  52.94 
 
 		 456 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  49.48 
 
 		 453 aa  89.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  54.22 
 
 		 448 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45.92 
 
 		 474 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.73 
 
 		 847 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  28.34 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.35 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.31 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  52.13 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  46.07 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  43.12 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  49.49 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  44.33 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  47.92 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  47.42 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  46.32 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  46.81 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  48.96 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.39 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.53 
 
 		 913 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  40.21 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  41.24 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  46.32 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  46.81 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  44.9 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40.91 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.89 
 
 		 846 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  30.88 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  38.53 
 
 		 854 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 678 aa  69.3  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 		 658 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.57 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  32.26 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  45.92 
 
 		 900 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  42.11 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  41.38 
 
 		 774 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  37.93 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.29 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  46.08 
 
 		 655 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  43.75 
 
 		 820 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  39.51 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  43.86 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  38.37 
 
 		 925 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  39.58 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  42.34 
 
 		 443 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.02 
 
 		 690 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  43.62 
 
 		 454 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  43.02 
 
 		 854 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  47.89 
 
 		 829 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.78 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  46.6 
 
 		 978 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.18 
 
 		 743 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  42.86 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 1128 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  36.26 
 
 		 1055 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.27 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  39.29 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  47.19 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>