64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0355 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  61.86 
 
 
268 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  54.87 
 
 
257 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  41.92 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  39.18 
 
 
217 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  38.28 
 
 
280 aa  158  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  44 
 
 
216 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  42.37 
 
 
197 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  41.48 
 
 
238 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  37.86 
 
 
230 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  45.56 
 
 
167 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  37.17 
 
 
231 aa  141  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  39.56 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  35.23 
 
 
871 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  37.71 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  30.65 
 
 
509 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  37.93 
 
 
232 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  27.6 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  27.78 
 
 
424 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  31.82 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  27.65 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  28.96 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  27.88 
 
 
383 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  29.61 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  29.58 
 
 
152 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  26.16 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  25.74 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  57.14 
 
 
48 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  30.11 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.8 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.23 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  26.37 
 
 
479 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  25.76 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  24.7 
 
 
447 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  23.7 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.14 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.17 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.9 
 
 
183 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.57 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  27.78 
 
 
1072 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  29.24 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  24.34 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  25.73 
 
 
188 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  29.56 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  20.42 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  24.66 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.12 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  25.15 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  24.05 
 
 
228 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  29.92 
 
 
197 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  28.65 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  25.16 
 
 
235 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  27.47 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.07 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  23.53 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  28.4 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  28.77 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  26.32 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0452  hypothetical protein  28.16 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564727  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5611  lipolytic protein G-D-S-L family  26.04 
 
 
589 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  27.01 
 
 
348 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  22.94 
 
 
188 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  26.62 
 
 
209 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>