29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1563 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1563  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 204 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0603  GDSL family lipase  73.06 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  0.0431523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  28.26 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  33.33 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.97 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  25.77 
 
 		 1072 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  27.84 
 
 		 593 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  24.74 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  34.29 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  26.67 
 
 		 479 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  24.24 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  27.95 
 
 		 372 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  26.59 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  24.58 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  30.56 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  30.52 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  29.76 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  26.02 
 
 		 593 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  28.98 
 
 		 447 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.57 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.4 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  26.74 
 
 		 648 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 		 262 aa  44.7  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.14 
 
 		 424 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  25.68 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  26.58 
 
 		 383 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  28 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  31.31 
 
 		 261 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>