59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2682 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
593 aa  1233    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  60.98 
 
 
593 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  52.8 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  39.64 
 
 
321 aa  170  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  30.93 
 
 
362 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  29.35 
 
 
479 aa  157  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  28.81 
 
 
358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  37.56 
 
 
260 aa  145  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 
262 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  28.66 
 
 
368 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  35.47 
 
 
1072 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  31.53 
 
 
226 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  32.34 
 
 
268 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.35 
 
 
221 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  27.78 
 
 
648 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  28.78 
 
 
249 aa  82  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40919  predicted protein  28.64 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  25.35 
 
 
236 aa  77  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  27.14 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  26.87 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26 
 
 
287 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  26.84 
 
 
243 aa  65.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  25.42 
 
 
348 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  21.53 
 
 
358 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.38 
 
 
265 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  24 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  25.5 
 
 
280 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  24.89 
 
 
329 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0019  putative acetylhydrolase  27.6 
 
 
262 aa  57.4  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.211042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  24.53 
 
 
274 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  24.26 
 
 
372 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0700  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.92 
 
 
196 aa  55.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  23.47 
 
 
217 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  25.6 
 
 
204 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  23.01 
 
 
341 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  23.81 
 
 
338 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  25.19 
 
 
386 aa  51.6  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  21.48 
 
 
180 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47870  predicted protein  23.48 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.504417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  23.27 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  26.86 
 
 
681 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  25.97 
 
 
230 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  21.88 
 
 
338 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  26.55 
 
 
383 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4195  lipase/acylhydrolase, putative  27.82 
 
 
259 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  20.9 
 
 
362 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4234  putative lipase/acylhydrolase  27.82 
 
 
259 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4347  lipase/acylhydrolase  27.07 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4032  lipase/acylhydrolase  27.07 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3865  lipase/acylhydrolase  27.07 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00404698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4148  putative lipase/acylhydrolase  27.07 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  20.49 
 
 
171 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  22.69 
 
 
334 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3879  lipase/acylhydrolase  27.07 
 
 
259 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00308721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4258  putative lipase/acylhydrolase  26.32 
 
 
259 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3955  GDSL family lipase  25.37 
 
 
259 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  23.88 
 
 
392 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  24.16 
 
 
231 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  21.21 
 
 
342 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>