36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1383 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  474  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  39.56 
 
 
248 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  34.2 
 
 
217 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  36.41 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  39.89 
 
 
268 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  36.79 
 
 
238 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  33.85 
 
 
231 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  36.6 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  36.27 
 
 
216 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  29.72 
 
 
509 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  31.61 
 
 
233 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  29.84 
 
 
197 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  28.5 
 
 
243 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  39.37 
 
 
167 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  27.98 
 
 
280 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  28.64 
 
 
207 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  28.22 
 
 
871 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  30.43 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.42 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  27.74 
 
 
152 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  25.4 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.71 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  28.24 
 
 
275 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  32.17 
 
 
372 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  25.95 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  24.19 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  26.74 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  26.13 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.01 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.83 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.32 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  33.06 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  25.68 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  20.21 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  25.58 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.42 
 
 
188 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>