More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5662 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5662  Carboxylesterase type B  100 
 
 		 589 aa  1170    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  30.84 
 
 		 506 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  34.08 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  48.31 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  31.92 
 
 		 525 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  44.8 
 
 		 502 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  33.96 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  31.23 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  41.34 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  41.06 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  33.72 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  40.64 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  31.76 
 
 		 498 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  34.16 
 
 		 522 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  40.64 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  40.64 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  32.71 
 
 		 528 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  40.64 
 
 		 502 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  31.83 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  31.81 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  30.68 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  30.82 
 
 		 529 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  39.48 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  38.72 
 
 		 537 aa  170  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  38.49 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  31.67 
 
 		 506 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  31.27 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  30.56 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  29.82 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  32.94 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  31.04 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  37.33 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  37.92 
 
 		 543 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1584  carboxylesterase, type B  44.78 
 
 		 522 aa  163  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1297  Carboxylesterase type B  33.96 
 
 		 571 aa  161  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  29.03 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  40.93 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  38.74 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  33.43 
 
 		 511 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  31.93 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  31.73 
 
 		 487 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  31.43 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  30.51 
 
 		 555 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  43.93 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  29.26 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0684  Carboxylesterase type B  34.37 
 
 		 574 aa  157  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  35.62 
 
 		 569 aa  156  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  36.81 
 
 		 565 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  37.41 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  34.67 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  30.6 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3376  Carboxylesterase type B  39.83 
 
 		 562 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  32.29 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  41.36 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  32.23 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  32.23 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  42.36 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  45.62 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  29.8 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  34.53 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  32.23 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  43.38 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  39.26 
 
 		 520 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  44.5 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  34.04 
 
 		 507 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  36.77 
 
 		 517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  44.1 
 
 		 506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  32.08 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  32.08 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  32.08 
 
 		 502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  30.95 
 
 		 540 aa  148  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  28.48 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  36.96 
 
 		 486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  35.76 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  38.58 
 
 		 576 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  40.27 
 
 		 501 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2933  Carboxylesterase type B  30.67 
 
 		 600 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0457474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  36.25 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  40.48 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  42.17 
 
 		 518 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  31.03 
 
 		 519 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  30.08 
 
 		 551 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  37.27 
 
 		 503 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  30.22 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  31.52 
 
 		 523 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  31.52 
 
 		 523 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  31.52 
 
 		 523 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3599  Carboxylesterase type B  32.7 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  31.72 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  31.22 
 
 		 523 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  28.82 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  28.49 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  31.08 
 
 		 491 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  36.6 
 
 		 472 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  42.6 
 
 		 532 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  29.94 
 
 		 519 aa  141  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11125  para-nitrobenzyl esterase  47.54 
 
 		 229 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  29.82 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  29.82 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  41.2 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.152473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>