239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2835 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  73.31 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  52.36 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  52.79 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  49.26 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  48.91 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  48.55 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  48.9 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  48.9 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  48.55 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  48.55 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  48.53 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  48.39 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  48.72 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  48.88 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  48.88 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  47.99 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  48.16 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  48.31 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  43.82 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  42.38 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  36.96 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  42.16 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  43.66 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  44.83 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  42.76 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  34.52 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  35.21 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  36.54 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  39.62 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  34.96 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  33.7 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  34.29 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  37.84 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  36.54 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  33.97 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  33.66 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  33.33 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  33.79 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  35.48 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  32.86 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  33.72 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  33.45 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  32.18 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  28.76 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  32.1 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.91 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  32.68 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  31.27 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  35.04 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  37.32 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  34.31 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  34.33 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  33.76 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  28.68 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  27.8 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  32.27 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.22 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  29.38 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.22 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.91 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.8 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  25.73 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  25.73 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  25.73 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  25.73 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.44 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.07 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  25.73 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  25.73 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  27 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.69 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.95 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.76 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.86 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  25.1 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  30.83 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  33.33 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.67 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  37.23 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.19 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.72 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.17 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  27.88 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  31.39 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  29.41 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  28.19 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.46 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  24.71 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.82 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.2 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.88 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.31 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  32.28 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.78 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  26.01 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.27 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  27.03 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  31.48 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>