149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0400 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  81.45 
 
 
275 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  65.54 
 
 
276 aa  318  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  66.67 
 
 
276 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  53.16 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  50.76 
 
 
283 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  51.66 
 
 
284 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  53.87 
 
 
288 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  51.7 
 
 
289 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  48.34 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  48.89 
 
 
275 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  48.86 
 
 
272 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  48.89 
 
 
275 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  48.89 
 
 
275 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  47.76 
 
 
278 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  47.76 
 
 
278 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  47.78 
 
 
275 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  48.29 
 
 
278 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  49.06 
 
 
268 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  46.67 
 
 
304 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  46.64 
 
 
283 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  47.39 
 
 
278 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  48.46 
 
 
269 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  48.46 
 
 
269 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  46.04 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  39.29 
 
 
264 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  32.83 
 
 
272 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  33.58 
 
 
271 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  38.85 
 
 
257 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  32.97 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.64 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  35.07 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  36.92 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  35.25 
 
 
288 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  37.25 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  35.74 
 
 
296 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  41.53 
 
 
271 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  32.13 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  35.81 
 
 
274 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  33.08 
 
 
291 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  34.87 
 
 
266 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  32.98 
 
 
301 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  34.16 
 
 
285 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  34.41 
 
 
277 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  31.25 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  31.38 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  33.59 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  31.82 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  30.51 
 
 
313 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  36.36 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  36.29 
 
 
284 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  32.27 
 
 
283 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  35.47 
 
 
284 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  30.77 
 
 
291 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  36.12 
 
 
280 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  32.14 
 
 
288 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  27.8 
 
 
261 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  35.36 
 
 
208 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.88 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  23.83 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.02 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.46 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.46 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.96 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.09 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.13 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  30.86 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  27.56 
 
 
412 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  27.95 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  27.56 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  27.17 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  33.33 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  27.17 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  27.17 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.05 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.87 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  28.68 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.85 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.26 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  28.12 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.02 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  30.42 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  34.19 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.65 
 
 
292 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  27.02 
 
 
289 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.26 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  24.54 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  29.63 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.57 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  24.89 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.31 
 
 
294 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.96 
 
 
360 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.25 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  35.64 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  25.38 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  30.17 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  30.74 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.42 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.15 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.8 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>