132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2492 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  53.21 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  55.21 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  56.2 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  56.03 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  50.38 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  46.69 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  43.68 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  38.87 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  35.25 
 
 		 296 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  36.4 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  32.08 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  32.73 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  32.23 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  32.23 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  33.7 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  32.21 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  31.84 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  28.46 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  33.76 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  33.09 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  33.09 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  31.02 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  31.02 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  33.62 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  31.02 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  32.01 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  31.02 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  31.02 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  31.02 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  25.46 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  30.11 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  27.8 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  28.89 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  30.91 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  29.46 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  31.11 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  25.86 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  25.75 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  27.11 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  29.06 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  30.34 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  28.63 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  27.76 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  32.81 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  31 
 
 		 288 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  29.06 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  33.19 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  28.3 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  31.05 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  29.43 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  28.24 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  27.13 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  25.41 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.42 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  25.23 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  32.22 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  32.31 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  26.82 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  35.43 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.7 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.7 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.87 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  29.61 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  34.17 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.87 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.07 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  28.66 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  27.43 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  29.19 
 
 		 412 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  33.62 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  29.01 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  33.62 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  33.62 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  33.62 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.57 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  30.63 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  26.88 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  27.59 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.97 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  32.35 
 
 		 324 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  34.19 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.39 
 
 		 1094 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  30.91 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  31.19 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.61 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.68 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.34 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  30.91 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  33.85 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.41 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.47 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  30.49 
 
 		 334 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  26.88 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  34.91 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  30.49 
 
 		 322 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  32.87 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>