197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3396 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  75.71 
 
 
305 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  62.5 
 
 
283 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  60.07 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  60.73 
 
 
288 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  55.8 
 
 
289 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  47.73 
 
 
275 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  46.04 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  43.75 
 
 
276 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  42.65 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  42.16 
 
 
284 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  39.85 
 
 
283 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  34.07 
 
 
272 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  40.46 
 
 
275 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  38.2 
 
 
278 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  32.45 
 
 
271 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  38.2 
 
 
278 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  38.2 
 
 
278 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  38.2 
 
 
269 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  38.2 
 
 
269 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  38.7 
 
 
272 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  39.03 
 
 
278 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  36.51 
 
 
264 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  38.61 
 
 
304 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  39.69 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  39.69 
 
 
275 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  38.58 
 
 
268 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  37.4 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  33.82 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  32.33 
 
 
288 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  31.16 
 
 
285 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  35.27 
 
 
284 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  35.2 
 
 
296 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  32.86 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  35.91 
 
 
280 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  35.85 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  35.86 
 
 
285 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  31.05 
 
 
291 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  32.36 
 
 
301 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.24 
 
 
294 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  32.91 
 
 
274 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  36.32 
 
 
291 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  30.72 
 
 
303 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  30.73 
 
 
324 aa  99.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  32.97 
 
 
313 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  29.92 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  36.11 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  31.29 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  31.18 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  33.88 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  29.13 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  29.06 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  33.21 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  26.74 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  36.08 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  36.08 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  30.21 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  26.97 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  30.08 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  29.94 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.08 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.43 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.66 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.93 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.07 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.98 
 
 
360 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.95 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  29.23 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  26.83 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  30.18 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  30.77 
 
 
412 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  28.65 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  30.77 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.21 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  30.77 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  30.18 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  29.59 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.58 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.32 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.12 
 
 
420 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  28.52 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.04 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  29.37 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.16 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.04 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  36.36 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.69 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.83 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  36.89 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  26.27 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  29.73 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.03 
 
 
326 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.18 
 
 
422 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.65 
 
 
336 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3093  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.03 
 
 
326 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  37.5 
 
 
274 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.62 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  33.08 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1624  esterase/lipase  29.36 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000487066  hitchhiker  0.00875756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.3 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>