171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1010 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 
284 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  98.24 
 
 
284 aa  550  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  75.49 
 
 
277 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  56.03 
 
 
261 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  55.47 
 
 
257 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  51.67 
 
 
274 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  45.15 
 
 
271 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  44.87 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  37.82 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  36.15 
 
 
276 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  35 
 
 
276 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  35.98 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  38.27 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  37.61 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  37.17 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  35.88 
 
 
303 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  29.48 
 
 
264 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  35.04 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  35.56 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  34.41 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  34.41 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  34.41 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  34.41 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  36.92 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  36.59 
 
 
275 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  36.59 
 
 
275 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  36.64 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  34.41 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  36.82 
 
 
278 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  37.35 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  36.64 
 
 
271 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  33.99 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  32.37 
 
 
285 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  36.75 
 
 
268 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  34.31 
 
 
288 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  35.29 
 
 
275 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  36.55 
 
 
289 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  32.17 
 
 
305 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  32.46 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  37.07 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  34.82 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  26.14 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  36.99 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  36.69 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  32 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  25.27 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  33.21 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  30.43 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  33.33 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  29.84 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  34.05 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  28.78 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  32.05 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  39.68 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  24.42 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  29.24 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.02 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  28.83 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  30.74 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.67 
 
 
301 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.02 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.02 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.65 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.88 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.1 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.98 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.43 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.44 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.52 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  34.81 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  32.67 
 
 
324 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  33 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  44.12 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  38.35 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.16 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  35 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  34.97 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  36.89 
 
 
412 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  36.89 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  36.89 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  36.89 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.8 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  30.32 
 
 
316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  33.93 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  36.89 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  36.89 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.16 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  29.31 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  38.79 
 
 
249 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  38.21 
 
 
406 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  36.51 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  31.85 
 
 
309 aa  55.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.45 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  31.86 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  33.33 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  36.45 
 
 
262 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  39.06 
 
 
291 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  31.69 
 
 
593 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  28.25 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>