275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1402 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  100 
 
 
324 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  33.98 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  33.99 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  38.11 
 
 
291 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  33.33 
 
 
287 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  30.46 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  35.29 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  34.3 
 
 
285 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.93 
 
 
294 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  35.62 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  31.83 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  31.27 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  30.72 
 
 
266 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  31.02 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  33.07 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  33.33 
 
 
296 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  31.38 
 
 
274 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  30.45 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  28.76 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  31.03 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  33.94 
 
 
305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  28.92 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  30.69 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  30.69 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  33.06 
 
 
275 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  30 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  29.64 
 
 
264 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  29.25 
 
 
285 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  29.27 
 
 
276 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  32.24 
 
 
284 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  32.87 
 
 
268 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  28.28 
 
 
275 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  27.21 
 
 
288 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  25.57 
 
 
271 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  30.73 
 
 
281 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  29.59 
 
 
271 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  27.59 
 
 
272 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  28.35 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  31.62 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  28.76 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  30.04 
 
 
256 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  31.19 
 
 
278 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  31.19 
 
 
278 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  30.95 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  31.19 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  31.19 
 
 
269 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  31.19 
 
 
269 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  31.19 
 
 
278 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  28.11 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.78 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  29.05 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  29.38 
 
 
208 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  29.67 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  27.66 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.83 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  28.19 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  24.6 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  24.6 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  24.6 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  24.6 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  24.21 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  27.65 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  23.81 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.23 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.21 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.27 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.81 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.31 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.06 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.43 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.74 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.27 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.48 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.33 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  27.97 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  23.11 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  24.92 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  26.36 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  28 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  28.26 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.71 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  25.41 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.37 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.75 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  28.64 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.38 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  25 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  22.73 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  23.94 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  25.08 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  24.12 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  23.97 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  22.26 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.08 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.41 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.94 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.24 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  25.58 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>