125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1863 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  100 
 
 
380 aa  725    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  41.9 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  33.85 
 
 
263 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  38.91 
 
 
261 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  40.65 
 
 
299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  37.92 
 
 
271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  39.16 
 
 
322 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  37.55 
 
 
268 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.31 
 
 
243 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  38.27 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  37.95 
 
 
245 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  40.94 
 
 
264 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  39.15 
 
 
279 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  36.4 
 
 
332 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  33.85 
 
 
273 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  34.68 
 
 
331 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  38.31 
 
 
268 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  31.12 
 
 
270 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  31.42 
 
 
249 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  37.77 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  35.82 
 
 
270 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  37.4 
 
 
221 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  33.6 
 
 
309 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  28.41 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  34.07 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  32.7 
 
 
292 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  35.29 
 
 
262 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  33.84 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  30.2 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  32.94 
 
 
261 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  28.7 
 
 
274 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  34.5 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.87 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  39.06 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  27.45 
 
 
285 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  28.03 
 
 
309 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  32.09 
 
 
275 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.49 
 
 
294 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  30.36 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  28.46 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.62 
 
 
1094 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  29.69 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  29.9 
 
 
308 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.75 
 
 
426 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.96 
 
 
272 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  28.18 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  34.75 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  30.6 
 
 
275 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  30.6 
 
 
275 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  27.08 
 
 
291 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  30.48 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.31 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  30.05 
 
 
272 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  24.29 
 
 
318 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  37.67 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  30.93 
 
 
268 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  33.5 
 
 
618 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  31.76 
 
 
275 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  29.44 
 
 
325 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  27.31 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  32.14 
 
 
593 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.49 
 
 
644 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  31.86 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  27.32 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  38.46 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  26 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  25.9 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  29.54 
 
 
257 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  31.06 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  30.19 
 
 
305 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  27.68 
 
 
632 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  40.37 
 
 
313 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0403  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.86 
 
 
588 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.892602  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  23.48 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.96 
 
 
349 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  35.92 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.08 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  26.27 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  30.04 
 
 
636 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  21.82 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  30.92 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  28 
 
 
261 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  32.04 
 
 
317 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  27.87 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  32.69 
 
 
274 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  27.87 
 
 
306 aa  46.2  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  32.81 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  31.03 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  32.81 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2293  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.73 
 
 
602 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  31.11 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  31.11 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  31.11 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  35.2 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6609  hypothetical protein  35.38 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234313  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  30.86 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  27.97 
 
 
618 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.02 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  36.45 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>