14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6609 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6609  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234313  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4356  hypothetical protein  42.17 
 
 
327 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2145  hypothetical protein  39.42 
 
 
328 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.21 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  32.47 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.71 
 
 
607 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.72 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0369  esterase  28.26 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.57 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  30.43 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  27.32 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  34.32 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  21.09 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>