108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0787 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
382 aa  785    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  31.18 
 
 
369 aa  142  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  29.54 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  29.45 
 
 
369 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.83 
 
 
410 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  25.87 
 
 
464 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.35 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  25.98 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  26.43 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  27.57 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  24.52 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  23.67 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.33 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  24.3 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.21 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.75 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  29.05 
 
 
347 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  25.77 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.66 
 
 
568 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.21 
 
 
488 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  25.71 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.16 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  24.93 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.16 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  25.48 
 
 
365 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.78 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  23.89 
 
 
449 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  27.78 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  27.94 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  32.35 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  25.64 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.66 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  24.37 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  21.94 
 
 
545 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  26.24 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  26.58 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  26.83 
 
 
547 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  22.73 
 
 
569 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  26.75 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.6 
 
 
449 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  26.96 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  22.73 
 
 
546 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  24.1 
 
 
607 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  24.31 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  24.91 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  26.13 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.5 
 
 
568 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.81 
 
 
565 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  27.46 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  23.28 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  26.35 
 
 
308 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.15 
 
 
474 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  26.22 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  28.23 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.52 
 
 
571 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.34 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.11 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  24.51 
 
 
713 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  26.33 
 
 
324 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  29.08 
 
 
336 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.03 
 
 
567 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  26.73 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  26.03 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  26.92 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.89 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.12 
 
 
601 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  25.62 
 
 
468 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  25.62 
 
 
468 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.77 
 
 
330 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.77 
 
 
361 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  26.79 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  33.82 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  25.21 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  25.21 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  28.66 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.23 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  22.85 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  21.97 
 
 
551 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  20.51 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  27.2 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  24.62 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  25.82 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.9 
 
 
543 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  23.14 
 
 
312 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.92 
 
 
526 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  26.44 
 
 
318 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  26.44 
 
 
318 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.17 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  25.94 
 
 
468 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  25.64 
 
 
345 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  28.31 
 
 
332 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  23.49 
 
 
567 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  22.8 
 
 
542 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  19.67 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  28.75 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  28.39 
 
 
509 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  24.14 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6609  hypothetical protein  29.57 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234313  normal  0.37846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>