100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2163 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
330 aa  688    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  34.26 
 
 
313 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.99 
 
 
361 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.6 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.87 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.96 
 
 
546 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  37.16 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  29.94 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.32 
 
 
456 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  23.1 
 
 
547 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.91 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  24.62 
 
 
568 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  31.33 
 
 
567 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.36 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  31.08 
 
 
601 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.7 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  23.27 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  31.18 
 
 
600 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.62 
 
 
565 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  31.18 
 
 
600 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  27.36 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  32.65 
 
 
551 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  26.06 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  30.87 
 
 
605 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.61 
 
 
488 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.64 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  30.47 
 
 
607 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  25.09 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.4 
 
 
569 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  28.08 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6609  hypothetical protein  27.21 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234313  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  32.33 
 
 
498 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  23.67 
 
 
572 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  25.08 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  23.79 
 
 
572 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  22.07 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  27.2 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.19 
 
 
568 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  28.36 
 
 
713 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1811  hypothetical protein  24.22 
 
 
642 aa  55.8  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.93 
 
 
498 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  28.71 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  22.1 
 
 
461 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39120  hypothetical protein  23.61 
 
 
414 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00513866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  24.9 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  22.91 
 
 
542 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  32.03 
 
 
407 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  23.81 
 
 
526 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  23.1 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.36 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  34.45 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  30.65 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  27.23 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  24.7 
 
 
570 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.77 
 
 
382 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  23.36 
 
 
468 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  34.45 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  34.45 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  28.83 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  22.84 
 
 
342 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  24.15 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 
474 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.19 
 
 
505 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  25.69 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  22.33 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  24.77 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  27.33 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  22.87 
 
 
468 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  27.33 
 
 
318 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  27.12 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.46 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  22.56 
 
 
468 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  22.99 
 
 
468 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.09 
 
 
443 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.17 
 
 
436 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  31.09 
 
 
876 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  29.82 
 
 
571 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  34.88 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  29.03 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0706  fused serine peptidase/N-terminal uncharacterized domain protein  26.83 
 
 
490 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.358194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  23.92 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  30.89 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  23.43 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  22.18 
 
 
468 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  22.18 
 
 
468 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15401  putative dienelactone hydrolase  25.76 
 
 
531 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  29.57 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11521  putative dienelactone hydrolase  22.39 
 
 
516 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  41.51 
 
 
868 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 
531 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  30.51 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  23.58 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  25.85 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  29.92 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  23.94 
 
 
509 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0700  hypothetical protein  28.44 
 
 
530 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0432534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>