47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
461 aa  947    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  27.04 
 
 
468 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  26.82 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  26.82 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  26.82 
 
 
468 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  27.19 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  26.09 
 
 
468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  24.84 
 
 
456 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.8 
 
 
488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  23.7 
 
 
456 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.44 
 
 
406 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  27.25 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  26.8 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  24.48 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.01 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.09 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.32 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  22.81 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.63 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  24.73 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  29.82 
 
 
713 aa  67  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.8 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  25.37 
 
 
546 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  25.9 
 
 
546 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.71 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.85 
 
 
546 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.53 
 
 
459 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.85 
 
 
547 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.2 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.9 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.05 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.17 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  22.1 
 
 
330 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 
531 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05159  conserved hypothetical protein  22.76 
 
 
580 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00674398  normal  0.449127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  26.91 
 
 
607 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.02 
 
 
426 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.14 
 
 
551 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  23.21 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  27.34 
 
 
323 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  25.97 
 
 
342 aa  47.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  26.74 
 
 
545 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  25.32 
 
 
568 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  25.29 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  47.37 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.26 
 
 
605 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  23.58 
 
 
866 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>