52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6054 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
425 aa  848    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  43.52 
 
 
407 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  38.87 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.02 
 
 
443 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.38 
 
 
370 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.77 
 
 
426 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.42 
 
 
436 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  31.74 
 
 
384 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  33.25 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  31.13 
 
 
373 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.07 
 
 
488 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.95 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  28.69 
 
 
456 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.62 
 
 
396 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.87 
 
 
393 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.25 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  27.05 
 
 
456 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  28.52 
 
 
468 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  28.96 
 
 
468 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  28.57 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  28.19 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  28.19 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  28.19 
 
 
468 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  30.92 
 
 
713 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  26.08 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  27.41 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.38 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.71 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  29.46 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  23.5 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  26.7 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.01 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.69 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.05 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  30.3 
 
 
607 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  24.04 
 
 
449 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.71 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.06 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1245  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.15 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.87 
 
 
568 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 
531 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.71 
 
 
459 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.61 
 
 
369 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.75 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  22.38 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  23.64 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  22.25 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  28.92 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  29.77 
 
 
545 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.78 
 
 
567 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  21.86 
 
 
453 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05159  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 
580 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00674398  normal  0.449127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>