31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3759 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 		 342 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.22 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  28.17 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  23.9 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  29.47 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  21.97 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1245  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.62 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  27.22 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.67 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  26.42 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.76 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.9 
 
 		 453 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.29 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.37 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.1 
 
 		 443 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.82 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.33 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.47 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.72 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25 
 
 		 426 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  25 
 
 		 468 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  24.43 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  25 
 
 		 468 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  24.43 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  24.43 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  24.77 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.75 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  33 
 
 		 547 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  28.7 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  26.2 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>