75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2596 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
426 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  43.28 
 
 
391 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  41.83 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  39.49 
 
 
384 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  38.64 
 
 
373 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  38.38 
 
 
373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  37.6 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  35.95 
 
 
407 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.77 
 
 
425 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.06 
 
 
443 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  31.41 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.45 
 
 
436 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.72 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.78 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.48 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  27.15 
 
 
468 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  29.15 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  27.37 
 
 
468 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  27.37 
 
 
468 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  28.8 
 
 
456 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  27.37 
 
 
468 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  26.68 
 
 
468 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  27.37 
 
 
468 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.81 
 
 
474 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  28.87 
 
 
546 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  27.88 
 
 
713 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  28.87 
 
 
546 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.7 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  27.22 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  26.84 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.18 
 
 
453 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.33 
 
 
382 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.88 
 
 
430 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  31.13 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26 
 
 
449 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.64 
 
 
453 aa  60.1  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  31.86 
 
 
568 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.78 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.11 
 
 
464 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  32.64 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  29.73 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.66 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  23.48 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
514 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  29.29 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  29.84 
 
 
567 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  23.68 
 
 
369 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.66 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  31.3 
 
 
605 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  32.31 
 
 
334 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  28.32 
 
 
373 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.68 
 
 
350 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.02 
 
 
461 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.06 
 
 
342 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  32.74 
 
 
526 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  25.89 
 
 
380 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.06 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  33.33 
 
 
543 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  34.65 
 
 
569 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  32.73 
 
 
568 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  34.91 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  25.86 
 
 
374 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  34.34 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.29 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.32 
 
 
567 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  30.77 
 
 
546 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 
600 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  33.64 
 
 
607 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  30.7 
 
 
551 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 
600 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  29.13 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  30.48 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  28.67 
 
 
289 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  24.21 
 
 
346 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  32.03 
 
 
302 aa  43.5  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>