34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0848 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  801    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1245  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  35.91 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.27 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.28 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.51 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.79 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  25.97 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  25.97 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  23.18 
 
 		 468 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  25.65 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  25.3 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  25.65 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.25 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.9 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  24.53 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  22.71 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.62 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.86 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  25.66 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.4 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  26.37 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  26.88 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.12 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  21.73 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  26.75 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  23.89 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.21 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  21.41 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  24.83 
 
 		 546 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.05 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  27.92 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  22.25 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.21 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  27.23 
 
 		 546 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>