124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2285 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  100 
 
 
410 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  29.9 
 
 
380 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.03 
 
 
382 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.48 
 
 
430 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  33.58 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.01 
 
 
464 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  33.58 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.87 
 
 
543 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.83 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  33.21 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  30.36 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  24.56 
 
 
449 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.46 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  35.03 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  34.67 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  26.13 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.22 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  33.05 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
542 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.38 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  28.85 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.16 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.87 
 
 
600 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.56 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.87 
 
 
600 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  27.52 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.69 
 
 
572 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.52 
 
 
436 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  32.02 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.97 
 
 
568 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  34.81 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  31.27 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.27 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.8 
 
 
607 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.24 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.19 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  30.99 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  26.02 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  35.82 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  26.03 
 
 
571 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.98 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  25.33 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  39.45 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  26.03 
 
 
570 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  26.21 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  24.75 
 
 
569 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.48 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  25.71 
 
 
713 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.86 
 
 
605 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  34.26 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  24.91 
 
 
568 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
533 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.77 
 
 
318 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.77 
 
 
318 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  31.64 
 
 
318 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  25.51 
 
 
601 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  30.39 
 
 
318 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.19 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  38.4 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  28.7 
 
 
526 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  22.83 
 
 
567 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  18.51 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  26.19 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.1 
 
 
565 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  35.71 
 
 
336 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  30.38 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  28.19 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.7 
 
 
498 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  41 
 
 
341 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  25.59 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.71 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  30.57 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  26.55 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.47 
 
 
567 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  20.38 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  28.29 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.46 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.61 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  40.21 
 
 
302 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  21.73 
 
 
391 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  35.1 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  24.03 
 
 
468 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  23.61 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  32.58 
 
 
316 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.7 
 
 
370 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  23.18 
 
 
468 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  23.61 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  23.18 
 
 
468 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  23.01 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  30.43 
 
 
278 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 
275 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  25.15 
 
 
342 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  26.32 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  21.41 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  25.99 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.08 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>