56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1449 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
436 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  41.29 
 
 
407 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  35.87 
 
 
424 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  34.36 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.49 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.35 
 
 
370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  35.75 
 
 
373 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.33 
 
 
393 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  31.46 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.76 
 
 
425 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.88 
 
 
396 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  30.63 
 
 
468 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  30.63 
 
 
468 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.48 
 
 
426 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  30.38 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  30.38 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  32.23 
 
 
468 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  30.38 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  28.83 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  28.39 
 
 
456 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.75 
 
 
373 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.03 
 
 
406 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.39 
 
 
488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  29.12 
 
 
474 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  26.42 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  26.45 
 
 
546 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  28.28 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.19 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.32 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.07 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  24.32 
 
 
713 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.82 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.17 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.14 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.22 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1245  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.61 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  31.87 
 
 
568 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  28.37 
 
 
449 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.23 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  32.03 
 
 
433 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  27.59 
 
 
337 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  28.46 
 
 
543 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
514 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  31.67 
 
 
567 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  28.1 
 
 
533 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.43 
 
 
464 aa  46.6  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.26 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4262  hypothetical protein  34.31 
 
 
883 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25 
 
 
369 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  30.51 
 
 
551 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.4 
 
 
572 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.16 
 
 
545 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.48 
 
 
607 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  30 
 
 
449 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>