41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3378 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  97.07 
 
 		 546 aa  979    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.9 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  24.8 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  24.8 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  24.49 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  25.25 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  24.6 
 
 		 468 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.94 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  24.66 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.49 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  25.37 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.75 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 		 453 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.67 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  28.36 
 
 		 407 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.87 
 
 		 426 aa  90.1  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.77 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  25.93 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  28.92 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  27.65 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.18 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.41 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  28.25 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  25.74 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.74 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.37 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  30.1 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.37 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.43 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.67 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.06 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.17 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05159  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 		 580 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00674398  normal  0.449127 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.29 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 514 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  24.83 
 
 		 391 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.61 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  29.45 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  38.98 
 
 		 341 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>