25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42917 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  100 
 
 
509 aa  1041    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.37 
 
 
488 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  24.31 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  23.33 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  23.82 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  23.33 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  23.72 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00990  platelet-activating factor acetylhydrolase 2, cytoplasmic, putative  31.29 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  24.67 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  30.23 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  26.35 
 
 
713 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.08 
 
 
456 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.79 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  23.61 
 
 
456 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
531 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  30.64 
 
 
546 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  29.65 
 
 
546 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05159  conserved hypothetical protein  21.17 
 
 
580 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00674398  normal  0.449127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.29 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.28 
 
 
474 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  23.1 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.39 
 
 
382 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  25.7 
 
 
407 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  35.94 
 
 
374 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2917  enterochelin esterase  38.81 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.112006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>