108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2228 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 
406 aa  839    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  53.23 
 
 
488 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  42.89 
 
 
456 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  42.89 
 
 
456 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  34.24 
 
 
468 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  33.25 
 
 
468 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  33.25 
 
 
468 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  33.25 
 
 
468 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  33.25 
 
 
468 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  33.67 
 
 
468 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  35.87 
 
 
407 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.3 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  31.29 
 
 
424 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  28.97 
 
 
713 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  34.05 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.45 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.48 
 
 
426 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  33.59 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.81 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  27.08 
 
 
373 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.03 
 
 
436 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.25 
 
 
425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.36 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  26.37 
 
 
546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.97 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  25.87 
 
 
546 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30 
 
 
459 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.44 
 
 
461 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  29.74 
 
 
453 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.01 
 
 
453 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.93 
 
 
370 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  24.51 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.36 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  38.66 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.22 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  36.43 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  24.3 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.76 
 
 
464 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  35.16 
 
 
545 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  33.87 
 
 
572 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.03 
 
 
449 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  31.36 
 
 
600 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  31.36 
 
 
600 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  33.87 
 
 
572 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  31.35 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  33.33 
 
 
605 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  30.25 
 
 
569 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.57 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  34.4 
 
 
533 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
547 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.02 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  23.79 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1245  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  20.83 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00990  platelet-activating factor acetylhydrolase 2, cytoplasmic, putative  22.98 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  30.6 
 
 
607 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  31.09 
 
 
601 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.76 
 
 
568 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  27.57 
 
 
449 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.72 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  26.11 
 
 
313 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  32 
 
 
567 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  27.27 
 
 
372 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  34.35 
 
 
567 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  25.84 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04154  conserved hypothetical protein  25 
 
 
531 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  30.33 
 
 
565 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.91 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  26.04 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
514 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.76 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  25 
 
 
543 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.76 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  21.95 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.89 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.89 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  25 
 
 
374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  24.21 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05159  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 
580 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00674398  normal  0.449127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.48 
 
 
685 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.52 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  26.45 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.37 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  25.15 
 
 
309 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  23.79 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  23.79 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  22.56 
 
 
324 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  30.16 
 
 
337 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  25.14 
 
 
308 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  27.64 
 
 
526 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  25.13 
 
 
322 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  24.64 
 
 
866 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  29.01 
 
 
876 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  24.03 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  24.6 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5505  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126724  decreased coverage  0.000198292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  27.27 
 
 
571 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  29.6 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.89 
 
 
336 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  21.2 
 
 
532 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>