163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4713 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  100 
 
 
365 aa  753    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  39.49 
 
 
373 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  39.36 
 
 
374 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  39.94 
 
 
372 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  41.11 
 
 
334 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  37.78 
 
 
352 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  66.67 
 
 
146 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  35 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  35.28 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  32.84 
 
 
330 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  33.33 
 
 
328 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  35.37 
 
 
339 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  35.78 
 
 
332 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  34.39 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  30.35 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.01 
 
 
339 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  30.03 
 
 
348 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 
338 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  29.15 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  29.71 
 
 
348 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  29.71 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.11 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  31.29 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.11 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  29.67 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  30.25 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  29.17 
 
 
327 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  30.15 
 
 
476 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  29.32 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  31.13 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  33.64 
 
 
547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  33.21 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  24.78 
 
 
341 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.49 
 
 
607 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.97 
 
 
318 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.44 
 
 
318 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.44 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.44 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.22 
 
 
543 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  26.69 
 
 
320 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.17 
 
 
337 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  32.69 
 
 
568 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.22 
 
 
551 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  27.76 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.24 
 
 
601 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.29 
 
 
572 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  30 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  30.51 
 
 
546 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  26.81 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  28.47 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  31.43 
 
 
533 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.33 
 
 
567 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  30.09 
 
 
542 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  32.33 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.71 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  32 
 
 
569 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  27.81 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.29 
 
 
545 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  27.24 
 
 
565 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  27.42 
 
 
605 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.17 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25.6 
 
 
571 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.51 
 
 
568 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  27.3 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  25.62 
 
 
570 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  37.14 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  25.99 
 
 
526 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  27.4 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  28.99 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.15 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.15 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.89 
 
 
464 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42917  predicted protein  30.23 
 
 
509 aa  66.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  25.88 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  34.26 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.13 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  28.15 
 
 
313 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  24.6 
 
 
449 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.48 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  36 
 
 
319 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.09 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.16 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  24.89 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  34.09 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  35.37 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.23 
 
 
505 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  23.87 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  36.36 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  34.68 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.78 
 
 
370 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  33.05 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.94 
 
 
645 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  33.61 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  25.19 
 
 
468 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  22.95 
 
 
467 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  35 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  25.78 
 
 
468 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  31.25 
 
 
319 aa  49.7  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>