86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1079 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  88.86 
 
 
369 aa  675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  758    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  88.35 
 
 
369 aa  681    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.54 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  26.25 
 
 
298 aa  63.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.09 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  24.4 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  21.61 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.76 
 
 
488 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27.23 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  26.56 
 
 
713 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  24.72 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  23.48 
 
 
547 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.98 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.98 
 
 
350 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  26.59 
 
 
456 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  23.73 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.67 
 
 
456 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  23.53 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  23.97 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  23.97 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  23.82 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  21.49 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  22.58 
 
 
543 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  24.45 
 
 
309 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.34 
 
 
361 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  23.21 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  23.18 
 
 
347 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  21.52 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  22.22 
 
 
565 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  23.73 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.68 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  24.29 
 
 
464 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  23.18 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  23.02 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  23.55 
 
 
449 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  26.27 
 
 
309 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  23.15 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  22.5 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  21.05 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  25.23 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.83 
 
 
568 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  25.1 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  23.62 
 
 
572 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  24.61 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  21.05 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  26.42 
 
 
322 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  22.98 
 
 
572 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  26.13 
 
 
756 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  22.88 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  25.78 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  23.35 
 
 
542 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  29.25 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  23.78 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  24.92 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  24.92 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  29.9 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.66 
 
 
607 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  22.48 
 
 
343 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  26.38 
 
 
313 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  22 
 
 
338 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  22.92 
 
 
551 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.27 
 
 
393 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.56 
 
 
569 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.47 
 
 
336 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  24.22 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.64 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  21.01 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0814  hypothetical protein  28.46 
 
 
248 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  19.23 
 
 
476 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  24.73 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  22.73 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  21.71 
 
 
570 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  31.58 
 
 
319 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  26.24 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  22.49 
 
 
600 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  22.49 
 
 
600 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.15 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  28.26 
 
 
318 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  24.51 
 
 
533 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  22.5 
 
 
546 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  23.08 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  29 
 
 
285 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.57 
 
 
474 aa  42.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  24.16 
 
 
384 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.28 
 
 
567 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>