29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1195 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  26.48 
 
 		 547 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 		 607 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  24.4 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  25.08 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.1 
 
 		 551 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  23.51 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  29.65 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  25.81 
 
 		 568 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  25.69 
 
 		 542 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6616  hypothetical protein  34.92 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.187623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.38 
 
 		 601 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  24.29 
 
 		 570 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  29.68 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.26 
 
 		 474 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.14 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.83 
 
 		 567 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  23.32 
 
 		 571 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  29.17 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.95 
 
 		 543 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  28.89 
 
 		 425 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2145  hypothetical protein  22.54 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  36.76 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  29.05 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>