123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0456 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  92.07 
 
 		 429 aa  807    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  72.49 
 
 		 429 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  871    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  63.61 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  63.38 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  63.38 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  58.6 
 
 		 432 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  58.6 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  58.6 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  58.6 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  58.6 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  58.6 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  63.12 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  64.99 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  58.29 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  59.43 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  64.72 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  53.94 
 
 		 308 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  52.06 
 
 		 312 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  52.26 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  49.21 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  47.69 
 
 		 309 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  34.01 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  45.6 
 
 		 279 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.53 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  27.64 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  30.98 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.13 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  31.17 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  33.78 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  33.55 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  27.5 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  26.9 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  26.9 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.5 
 
 		 596 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  30.77 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  29.29 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 		 695 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2245  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  30.36 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.563783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.31 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  29.56 
 
 		 741 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  28.74 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  26.63 
 
 		 339 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.91 
 
 		 665 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 		 651 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.71 
 
 		 653 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  23.81 
 
 		 275 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.68 
 
 		 638 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30.51 
 
 		 710 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 625 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  26.63 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.57 
 
 		 721 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  31.75 
 
 		 876 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  33.91 
 
 		 576 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.37 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  26.02 
 
 		 763 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.26 
 
 		 621 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.07 
 
 		 648 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.83 
 
 		 760 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  32.89 
 
 		 897 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.07 
 
 		 653 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.23 
 
 		 653 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.79 
 
 		 767 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  25.89 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  26.02 
 
 		 763 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  24.79 
 
 		 763 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.09 
 
 		 776 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.26 
 
 		 771 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.79 
 
 		 766 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.1 
 
 		 628 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 		 610 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  26.02 
 
 		 763 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.87 
 
 		 611 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.94 
 
 		 612 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  24.32 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.17 
 
 		 634 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.54 
 
 		 944 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  31.2 
 
 		 497 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.65 
 
 		 688 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.23 
 
 		 572 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2433  hypothetical protein  27.97 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.41 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  24.02 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.33 
 
 		 735 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  33.33 
 
 		 1010 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.93 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  32.08 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  26.25 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  23.08 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  26.71 
 
 		 735 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.35 
 
 		 767 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  31.3 
 
 		 580 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  25.3 
 
 		 670 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.62 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.66 
 
 		 648 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>