44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6636 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1179  dienelactone hydrolase  37.44 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.401039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6559  dienelactone hydrolase-like protein  36.61 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04550  dienelactone hydrolase-like enzyme  32.41 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0809694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13475  hypothetical protein  37.67 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000130156  hitchhiker  0.00071947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0876  hypothetical protein  28.1 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4940  hypothetical protein  30.43 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  31.28 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1138  hypothetical protein  28.4 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1155  hypothetical protein  28.4 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0655389  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1165  hypothetical protein  28.4 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746782  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1708  hypothetical protein  31.37 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  26.85 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  27.35 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  31.09 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1479  hypothetical protein  31.36 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.909184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  29.07 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  25.58 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  28.46 
 
 
472 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  29.35 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  29.59 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  24.82 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  26.15 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  26.77 
 
 
323 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  27.34 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3992  hypothetical protein  22.79 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.51 
 
 
361 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  28.14 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6616  hypothetical protein  28.37 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.187623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.68 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.31 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.07 
 
 
350 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  24.81 
 
 
568 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  23.23 
 
 
567 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  26.27 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  25.85 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  29.3 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  25.87 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  26.04 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  25.84 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  25.81 
 
 
551 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  25.83 
 
 
547 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  25.96 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  27.56 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>