130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0878 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  84.15 
 
 		 347 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  45.88 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  42.99 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  39.12 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  31.72 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  30.38 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.5 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  29.32 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  33.7 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  28.7 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  28.4 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  27.14 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  28.48 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  26.46 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  31.98 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  27.55 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  30.42 
 
 		 318 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.35 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  28.99 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  28.92 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  29.05 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  31.07 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.1 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.1 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  27.98 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  29.04 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  29.32 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  29.47 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  27.55 
 
 		 320 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  26.71 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  26.54 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  28.42 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.22 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  26.11 
 
 		 476 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  27.92 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.15 
 
 		 551 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.64 
 
 		 568 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  29.75 
 
 		 567 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28 
 
 		 607 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.68 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.21 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.56 
 
 		 543 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  27.08 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.1 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 		 567 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  27.94 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.7 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  25.08 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.42 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.52 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  28.05 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  25.6 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.45 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.84 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.69 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  25.96 
 
 		 572 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.92 
 
 		 547 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  32.72 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.34 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  25.96 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  25.93 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  32.42 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.54 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  23.44 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.67 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  30.99 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  26.32 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.9 
 
 		 565 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.8 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.32 
 
 		 600 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.32 
 
 		 600 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  24.48 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.55 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  28.57 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  26.07 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  22.84 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  25.11 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  35.65 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  34.19 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  33.04 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  23.18 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.64 
 
 		 665 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  30.51 
 
 		 498 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  35.77 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  29.38 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  32.54 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  32.52 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  34.82 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.65 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  33.04 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.19 
 
 		 456 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.63 
 
 		 498 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11451  putative dienelactone hydrolase  30.09 
 
 		 550 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.338208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.24 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  27.97 
 
 		 146 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  30.36 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>