71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0814 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0814  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15680  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 
236 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3629  hypothetical protein  38.71 
 
 
245 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.267254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2125  hypothetical protein  38.59 
 
 
265 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3191  hypothetical protein  42.11 
 
 
236 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2077  hypothetical protein  41.7 
 
 
236 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2907  hypothetical protein  42.26 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3185  hypothetical protein  41.3 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2954  hypothetical protein  41.84 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.032599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3178  hypothetical protein  41.84 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2871  hypothetical protein  41.6 
 
 
236 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2933  hypothetical protein  40.89 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0694747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3182  hypothetical protein  41.06 
 
 
236 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0937761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3163  hypothetical protein  39.43 
 
 
236 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.964275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1499  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0226189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2666  hypothetical protein  34.54 
 
 
280 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.490325 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17270  predicted membrane protein  31.62 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.692872  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0521  hypothetical protein  40.66 
 
 
236 aa  138  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2249  hypothetical protein  35.34 
 
 
253 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0862761 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1544  hypothetical protein  35.38 
 
 
254 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0092  hypothetical protein  29.05 
 
 
328 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1019  hypothetical protein  31.88 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  0.277845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04620  hypothetical protein  35.84 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3758  hypothetical protein  35.06 
 
 
280 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0107  hypothetical protein  38.2 
 
 
323 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0227  hypothetical protein  34.08 
 
 
310 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482359  normal  0.182305 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2395  hypothetical protein  39.34 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36760  hypothetical protein  30.29 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46456  predicted protein  28.71 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  26.54 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
281 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  31.13 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  58.33 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  28.79 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
340 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  28.57 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
461 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  27.82 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  29.41 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  47.62 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  43.9 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3334  hypothetical protein  40.74 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  62.5 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  53.12 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46290  poly(3-hydroxybutyrate) synthase subunit  53.66 
 
 
364 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  58.06 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  25.56 
 
 
369 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
301 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  32.94 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 
333 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  34.33 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
294 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  31.63 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  31.11 
 
 
276 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  35 
 
 
230 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
295 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
302 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 
275 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>