84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1126 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  97.14 
 
 		 350 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  100 
 
 		 350 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  71.29 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.93 
 
 		 568 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.87 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  29.59 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  29.11 
 
 		 526 aa  92.8  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.85 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  25.16 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  29.11 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  31.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  33.55 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  26.92 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  24.82 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.97 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.33 
 
 		 605 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.33 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  27.46 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  22.1 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.43 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.78 
 
 		 600 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.78 
 
 		 600 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.6 
 
 		 601 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  26.21 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.77 
 
 		 567 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  25.75 
 
 		 547 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.57 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  32.68 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  30.5 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  29.51 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  29.86 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  38.94 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  34.51 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1811  hypothetical protein  25.54 
 
 		 642 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  25.98 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  30.16 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  33.9 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  32.43 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.11 
 
 		 571 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  29.14 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  30.67 
 
 		 542 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.97 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  28.4 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.76 
 
 		 406 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.91 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.47 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  33.57 
 
 		 638 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.78 
 
 		 652 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  30.56 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  38.89 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.55 
 
 		 678 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.68 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  24.27 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  32.09 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.84 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.47 
 
 		 474 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  31.69 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.5 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.46 
 
 		 572 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 868 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  28.21 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  21.3 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  29.46 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  32.74 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  26.98 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  33.33 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  32.74 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  27.34 
 
 		 572 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  20.83 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  30 
 
 		 498 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.69 
 
 		 456 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  34.88 
 
 		 635 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  31.3 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.99 
 
 		 638 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  25.76 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  31.9 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.03 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.76 
 
 		 653 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  31.86 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.67 
 
 		 657 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  31.86 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  27.45 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>