26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0658 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  32.7 
 
 
286 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  36.84 
 
 
285 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  32.09 
 
 
279 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4204  hypothetical protein  33.48 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0428  hypothetical protein  28.42 
 
 
417 aa  75.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  24.78 
 
 
756 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  28.23 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  28.26 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  27.75 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  26 
 
 
284 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  23.98 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  26.89 
 
 
281 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  24.03 
 
 
567 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  30.53 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  22.81 
 
 
551 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  29.9 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  26.8 
 
 
568 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  24.3 
 
 
301 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  25.62 
 
 
533 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  24.18 
 
 
319 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  30.93 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  23.41 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  25.54 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  35.8 
 
 
752 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  26.17 
 
 
572 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>