101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1024 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  42.24 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  43.29 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  42.62 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  42.62 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  39.63 
 
 
336 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  39.86 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  39 
 
 
320 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  38.6 
 
 
341 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  40.94 
 
 
337 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  34.53 
 
 
346 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  32.83 
 
 
476 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  33.98 
 
 
339 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  33.54 
 
 
348 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  33.54 
 
 
348 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  33.54 
 
 
348 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  35.16 
 
 
345 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  35.79 
 
 
410 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.97 
 
 
365 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  30.7 
 
 
439 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  29.54 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  31.45 
 
 
334 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  29.68 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.31 
 
 
347 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  29.35 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.51 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  29.47 
 
 
373 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  30.96 
 
 
374 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  31.38 
 
 
316 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  31.96 
 
 
372 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  30.3 
 
 
352 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.45 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  28.99 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  31.8 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  30.8 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.5 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.29 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  29.72 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.34 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  28.52 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  26.84 
 
 
545 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  28.04 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.31 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  26.93 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  28.33 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  25.5 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.6 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  27.27 
 
 
570 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  27.43 
 
 
571 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  29.26 
 
 
542 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.73 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.89 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.92 
 
 
551 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  26.46 
 
 
547 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.55 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  27.51 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  28.49 
 
 
568 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  30.22 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  24.32 
 
 
572 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.41 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  25.14 
 
 
572 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.71 
 
 
565 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  28.18 
 
 
146 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.87 
 
 
382 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.22 
 
 
526 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  27.64 
 
 
449 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.69 
 
 
600 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.69 
 
 
600 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.63 
 
 
464 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  23.89 
 
 
449 aa  55.8  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  30.92 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.37 
 
 
605 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  24.15 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  25.14 
 
 
533 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.36 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.93 
 
 
430 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  30.25 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  22.66 
 
 
601 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  30.67 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  30.14 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  25.2 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  26.38 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  34.71 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  24.82 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  33.02 
 
 
319 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  24.73 
 
 
369 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  29.37 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  30.48 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  31.48 
 
 
524 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.45 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  28.76 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  31.21 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  34.18 
 
 
472 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  40.21 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.84 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  26.42 
 
 
348 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.64 
 
 
968 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  26.02 
 
 
433 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>