105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0593 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  100 
 
 		 320 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  56.05 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  54.64 
 
 		 318 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  54.64 
 
 		 318 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  54.3 
 
 		 318 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  52.09 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  42.86 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  44.86 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  39 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  34.66 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  30.25 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  29.82 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.81 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  32.96 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  32.58 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  32.2 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  29.26 
 
 		 410 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  27.04 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  29.64 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  30.51 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  31.32 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  30 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  31.23 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.32 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  28.98 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  25.72 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.55 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  25.16 
 
 		 439 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.01 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  26.95 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.83 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  29.48 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  26.9 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  28.66 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.96 
 
 		 543 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.56 
 
 		 567 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  30.41 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  28.67 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.79 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.34 
 
 		 572 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.34 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  32.24 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.27 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  27.59 
 
 		 601 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 546 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  29.9 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.57 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.53 
 
 		 551 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.06 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  30.77 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  28.09 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.64 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 464 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.89 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  25.19 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  23.26 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  27.04 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  35.04 
 
 		 449 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  24.73 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.44 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  30.39 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  29.41 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  26.07 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  29.69 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  28.32 
 
 		 542 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  25.56 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  38.4 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  33.06 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  24.26 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25.5 
 
 		 571 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  34.95 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  28.49 
 
 		 433 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  30.77 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  32.26 
 
 		 600 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  32.26 
 
 		 600 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.59 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  33.07 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.49 
 
 		 605 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.79 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  25.78 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  25.78 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.46 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.82 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  26.98 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  34.69 
 
 		 389 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  34.21 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.32 
 
 		 396 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44153  predicted protein  27.66 
 
 		 507 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.18 
 
 		 488 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  32.76 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  27.43 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  29.23 
 
 		 498 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  29.2 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.95 
 
 		 1010 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  24.37 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  31.03 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>