88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6097 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  60.86 
 
 
330 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  49.24 
 
 
339 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  48.01 
 
 
342 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  42.47 
 
 
328 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  33.54 
 
 
373 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  35.19 
 
 
334 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  35.78 
 
 
365 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  34.76 
 
 
372 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  35.74 
 
 
343 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.81 
 
 
374 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  30.68 
 
 
278 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  30.71 
 
 
302 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  31.96 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.93 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  28.97 
 
 
342 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  28.53 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  28.03 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  24 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  26.3 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  28 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  26.43 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  25.97 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  25.32 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.7 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.04 
 
 
601 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.32 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.44 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.59 
 
 
543 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  25.61 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  26.32 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.67 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  25.93 
 
 
545 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  23.9 
 
 
546 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  24.82 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  37.07 
 
 
146 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  27.48 
 
 
439 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.91 
 
 
449 aa  63.2  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.97 
 
 
568 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  25.82 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  26.92 
 
 
565 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  25.82 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  25.82 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  24.45 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.57 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  24.43 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  27.61 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.7 
 
 
569 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  22.98 
 
 
542 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  25.69 
 
 
476 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  25.1 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.23 
 
 
600 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.35 
 
 
571 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.23 
 
 
600 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  24.27 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.95 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  25.7 
 
 
567 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
551 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  24.77 
 
 
572 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.77 
 
 
605 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.9 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
572 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  27.41 
 
 
410 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  30.81 
 
 
464 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  27.27 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.67 
 
 
533 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  35 
 
 
300 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.55 
 
 
505 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.64 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  28.47 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  28.04 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.98 
 
 
382 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  25.58 
 
 
526 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  24.89 
 
 
547 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  26.2 
 
 
316 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0684  esterase  26.42 
 
 
249 aa  46.2  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3640  esterase  26.42 
 
 
249 aa  46.2  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.34 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  26.15 
 
 
665 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  23.53 
 
 
567 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
644 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3786  esterase  26.02 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
644 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  29.81 
 
 
642 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  20.41 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.96 
 
 
755 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>