80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1192 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  634    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  46.98 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  44.37 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  29.45 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.75 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.48 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  33.12 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  32.89 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.65 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.41 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.88 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.88 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  31.32 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.76 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  29.84 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  31.51 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  33.73 
 
 		 476 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  33.54 
 
 		 410 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  27.88 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  25.45 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.34 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  33.77 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  38.41 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  27.11 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.05 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.4 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  29.84 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.6 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  28.09 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  26.5 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  25.27 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  28.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  26.94 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  33.82 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  35.78 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.74 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.18 
 
 		 607 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  24.89 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.33 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  30.61 
 
 		 600 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  30.61 
 
 		 600 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.11 
 
 		 543 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  31.32 
 
 		 464 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  22.76 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  24.83 
 
 		 542 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.7 
 
 		 567 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  28.7 
 
 		 498 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.22 
 
 		 382 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.13 
 
 		 567 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  29 
 
 		 259 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  29 
 
 		 259 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  22.66 
 
 		 570 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  25.4 
 
 		 572 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  32.28 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  32.02 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  29.23 
 
 		 547 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  30.54 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  35.45 
 
 		 568 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  25.4 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.2 
 
 		 568 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  21.57 
 
 		 571 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  27.2 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  27.9 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.41 
 
 		 545 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  22.3 
 
 		 449 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.58 
 
 		 565 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  32.47 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  24.21 
 
 		 533 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.51 
 
 		 605 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.04 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  26.9 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  34.02 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  31.9 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  32.19 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  24 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  28 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  53.06 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  24.59 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  31.86 
 
 		 526 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  23.43 
 
 		 449 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>