15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1021 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  26.24 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  29.38 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.36 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  33.04 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  30 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.15 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  29.38 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  34.69 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  32.67 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  26.38 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  33.07 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.16 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.94 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>