81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1306 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  87.83 
 
 
342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  48.2 
 
 
330 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  49.24 
 
 
332 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  46.11 
 
 
328 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  35.82 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  35.8 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  35.37 
 
 
365 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  33.14 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  32.55 
 
 
372 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  33.45 
 
 
343 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  32.63 
 
 
278 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  32.98 
 
 
352 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  28.83 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.37 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.57 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.1 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.88 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  27.22 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  26.58 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  26.58 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  38.79 
 
 
146 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  26.2 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  24.47 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  29.33 
 
 
545 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.23 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  26.97 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.86 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  28.64 
 
 
546 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.43 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.43 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.95 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.46 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  27.17 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.53 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  25.71 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.15 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.8 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28 
 
 
569 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.46 
 
 
607 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  27.15 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  25.97 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  25.11 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  24.57 
 
 
572 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  33.06 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  28.3 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.51 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.51 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.37 
 
 
449 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  26.89 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  22.59 
 
 
565 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  24.83 
 
 
572 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.14 
 
 
543 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.38 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.27 
 
 
568 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  24.46 
 
 
542 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  25.85 
 
 
533 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.14 
 
 
464 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  27.51 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.51 
 
 
600 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.51 
 
 
600 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  25.84 
 
 
567 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  29.11 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.23 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  27.1 
 
 
605 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  37.5 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  28.77 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.96 
 
 
551 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  24.02 
 
 
547 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  26.35 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  28.97 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  28.28 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.77 
 
 
336 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  24.88 
 
 
568 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  25.67 
 
 
526 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  29.44 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  30.15 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  36.36 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  46.15 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  26.21 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>