63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2566 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  100 
 
 
439 aa  892    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  40.87 
 
 
476 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  41.62 
 
 
410 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  38.99 
 
 
376 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  29.75 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.66 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.45 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  30.13 
 
 
348 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  30.82 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  30.77 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  30.91 
 
 
330 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.78 
 
 
347 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  30.87 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  29.97 
 
 
337 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.13 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  29.77 
 
 
318 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  29.77 
 
 
318 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  25.53 
 
 
320 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  26.71 
 
 
318 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.16 
 
 
347 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  26.43 
 
 
298 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  25.7 
 
 
365 aa  94.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  26.58 
 
 
336 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  25.68 
 
 
373 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  27.11 
 
 
316 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  25 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.23 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.35 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  26.07 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.01 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  27.72 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  22.47 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.97 
 
 
339 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  30.67 
 
 
340 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  25.29 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  25.67 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  20.94 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  23.33 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  24.85 
 
 
328 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.6 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  27.48 
 
 
332 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  22.85 
 
 
312 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.79 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  22.43 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  25.38 
 
 
343 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  24.91 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  23.58 
 
 
449 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.28 
 
 
382 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  25.09 
 
 
330 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.3 
 
 
605 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.18 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  22.61 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  22.74 
 
 
543 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  22.61 
 
 
572 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  25.13 
 
 
542 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  23.71 
 
 
545 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  32.08 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  23.35 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  23.71 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  23.04 
 
 
533 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  23.35 
 
 
547 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  23.15 
 
 
546 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>