120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5513 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  100 
 
 
318 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  98.43 
 
 
318 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  98.43 
 
 
318 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  81.45 
 
 
318 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  54.46 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  54.31 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  49.68 
 
 
341 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  48.31 
 
 
336 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  46.52 
 
 
327 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  43.29 
 
 
330 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  31.66 
 
 
339 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  32.01 
 
 
346 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  32.53 
 
 
345 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  32.28 
 
 
476 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.36 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  30.51 
 
 
410 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  30.07 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.07 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.35 
 
 
298 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.16 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  33.43 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  33.81 
 
 
374 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  30.21 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  28.87 
 
 
376 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  32.18 
 
 
334 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  31.19 
 
 
373 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  29.25 
 
 
347 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  27.62 
 
 
365 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  31.1 
 
 
372 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  29.13 
 
 
439 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 
338 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  30.11 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.96 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  33.33 
 
 
607 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  25.55 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.08 
 
 
551 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  30.57 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  28.84 
 
 
543 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  31.02 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  35.88 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.14 
 
 
546 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  32.93 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  28.02 
 
 
567 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.68 
 
 
568 aa  72.4  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.74 
 
 
567 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  29.9 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.36 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  28.86 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27.06 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  27.94 
 
 
572 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  26.48 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.45 
 
 
569 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  29.02 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  26.76 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  28.16 
 
 
605 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  39.68 
 
 
464 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  25.85 
 
 
533 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  26.32 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  29 
 
 
545 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.23 
 
 
449 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  28.38 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.95 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  31.66 
 
 
433 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  27.41 
 
 
526 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  31.64 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.99 
 
 
601 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  29.82 
 
 
565 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  30.99 
 
 
498 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  31.55 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  30.23 
 
 
430 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  25.45 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.82 
 
 
396 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  32.69 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.46 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.55 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.92 
 
 
369 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  21.89 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  21.89 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.13 
 
 
600 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  29.75 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.13 
 
 
600 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.79 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  29.37 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  28.32 
 
 
542 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  24.86 
 
 
570 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.91 
 
 
629 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  26.42 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  33.91 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.72 
 
 
361 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
514 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.76 
 
 
571 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  26.52 
 
 
318 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  26.63 
 
 
721 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.61 
 
 
706 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.35 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  35.04 
 
 
634 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.91 
 
 
638 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>